ARPAT vanta una lunga esperienza nel campo del monitoraggio e della tutela della biodiversità, con particolare riferimento alla tutela degli ecosistemi marino-costieri. Tra le esperienze più significative: ARPAT svolge inoltre attività di supporto tecnico scientifico a favore della Regione Toscana per la gestione del settore produttivo della pesca. Nell’ambito di tali attività – orientata al monitoraggio quali-quantitativo del pescato – origina una grandissima quantità di dati che, letti nell’ottica della biodiversità, forniscono un quadro conoscitivo delle modificazioni dell’habitat marino indispensabile ai fini della sua conservazione.