ARPAT ha competenze istruttorie e di controllo.
Per quanto riguarda le competenze istruttorie, esprime il proprio parere all’interno dei procedimenti autorizzativi di acque reflue industriali, di acque reflue urbane, per acque meteoriche di dilavamento contaminate e per le acque reflue assimilate alle domestiche. In quest’ultimo caso solo per quelle con scarico al di fuori della fognatura pubblica e con potenzialità superiore a 100 abitanti equivalenti (AE).
Per quanto riguarda l’attività di controllo ARPAT effettua controlli sugli scarichi industriali, urbani e di acque meteoriche contaminate. Non effettua controlli per quanto riguarda gli scarichi di acque reflue domestiche ed assimilate.